05CHV1

Résumé de l’opération

Les objectifs de l’opération de contrôle 05CHV1 étaient :

• l'évaluation des performances des laboratoires pour la quantification de l'ARN-VIH 1 plasmatique en termes de variabilité inter-laboratoires et intra-laboratoire,
• la comparaison de ces performances entre les protocoles utilisés,
• et l'étude de l'évolution des résultats des laboratoires observés depuis 1997, date d'initiation de ce contrôle.

Pour cela, les 131 laboratoires concernés par la quantification de l’ARN du Virus de l’Immunodéficience Humaine de type 1(VIH1) ont reçu un panel de 4 échantillons ou deux panels de 4 échantillons s’ils utilisent deux réactifs.
Ces 4 échantillons se décomposent comme suit : un échantillon négatif (05-4A, 05-1B, 05-3D et 05-2E), un échantillon positif de niveau 1 (05-2A, 05-3B, 05-4D et 05-4E) et un échantillon positif de niveau 2 présenté en duplicate (05-1A et 05-3A, 05-2B et 05-4B, 05-1D et 05-2D, 05-1E et 05-3E).
L’échantillon de niveau 1 a été préparé à partir de plasmas d’un patient connu pour être infecté par un virus CRF02 (Cameroun). Il s’agit d’un virus VIH-1 appartenant à un groupe de virus assez présents en France.
Les solutions présentes dans les échantillons positifs du niveau 2 avaient été préparées en 2003 à partir d'un surnageant de culture de virus VIH-1 (groupe M) de sous-type B et avaient déjà été envoyées à l’opération de contrôle de 2003 (03CHV1). La même souche est utilisée depuis 1997.
La quantité du niveau 2 avait été choisie autour de 10000 copies/ml (soit autour de 4,0 log de copies/ml) et ce niveau est présenté en duplicate afin de mettre en évidence les éventuelles difficultés des laboratoires à reproduire des mesures au seuil de 10000 copies/ml.
Les résultats de cette opération de contrôle sont satisfaisants, on note peu de valeurs aberrantes. Cela a permis une comparaison des résultats entre laboratoires et entre réactifs utilisés.
Pour le niveau 1, de grosses différences de résultats ont été enregistrées, cela peut s’expliquer par la nature du génotype du virus et par le niveau d’ARN-VIH1 proche du seuil de détection de certains réactifs.
L’écart entre les quantifications obtenues avec les réactifs Roche Amplicor Monitor et celles obtenues avec le réactif Bayer Versant (bDNA) est à peu près similaire à celui observé lors de la dernière opération de contrôle de décembre 2003 et est de 0,09 log copies/ml au niveau 2.
Cette opération de 2005 a permis de constater pour la première fois l’utilisation d’un réactif de PCR en temps réel : Roche Diagnostics Cobas taq Man HIV1 test. Cependant, avec ce réactif, on note un écart important entre les résultats obtenus avec l’extracteur automatique Ampliprep et ceux obtenus avec extraction manuelle.

Échantillons [05-1A, 05-2A, 05-3A, 05-4A] ou [05-1B, 05-2B, 05-3B, 05-4B] ou [05-1D, 05-2D, 05-3D, 05-4D] ou [05-1E, 05-2E, 05-3E, 05-4E] : ARN du virus du VIH 1