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Résumé de l’opération

Cet envoi comportait deux souches lyophilisées à identifier. Il s’agissait de deux entérobactéries proposées pour la première fois dans le cadre du CNQ : Serratia fonticola et Pantoea agglomerans, présentes dans l’environnement (eau, sol ou plantes) mais peu fréquemment isolées chez l’homme.
Les résultats sont bons avec 91,3% d’identifications exactes pour S. fonticola ; score à comparer avec celui obtenu, lors d’un contrôle précédent, pour une autre Serratia : S. marcescens (86%).
Quant à Pantoea agglomerans, espèce créée à la suite des problèmes taxonomiques posés par le « complexe Enterobacter agglomerans », elle a été précisément identifiée par 87,3% des participants tandis que 5,2% d’entre eux se sont arrêtés au diagnostic de genre « Pantoea sp. ».

Cette opération comportait également pour identification et antibiogramme, deux souches de staphylocoques lyophilisées : Staphylococcus aureus et Staphylococcus lugdunensis.
En ce qui concerne S. aureus, seuls 15 laboratoires sur 1389 ont rendu une identification erronée. Il s’agissait d’une souche Méti-R avec une résistance associée aux fluoroquinolones et à la tétracycline. Ces trois types de résistance n’ont pas été détectés par respectivement 4,2%, 3,9% et 3,7% des laboratoires.
En ce qui concerne S. lugdunensis, on note par rapport au contrôle précédent en 2005, une nette amélioration (+ 16%) de l’identification de cette espèce avec 79% de réponses correctes. Toutefois, l’analyse détaillée des réponses montre que 60 laboratoires sur 1333 confondent encore S. lugdunensis avec S. aureus. Cette souche était sensible à tous les antibiotiques à l’exception de la pénicilline G. On observe un pourcentage non négligeable de faux « Résistant » ou « Intermédiaire » à la tétracycline (5,1%), au cotrimoxazole (2,5%) ou à la fosfomycine (2,2%) et, plus inquiétant, près de 14% des laboratoires ont rendu, à tort, cette souche résistante à la méticilline.

Identification bactérienne : Serratia fonticola, Pantoea agglomerans / Identification et antibiogramme d’un staphylocoque : S. aureus, S. lugdunensis