14VHC1

Résumé de l’opération

Les 105 laboratoires concernés par cette opération ont reçu 5 échantillons différents pour la détection et/ ou la quantification de l’ARN du virus de l’hépatite C (VHC) et/ou le génotypage. Les échantillons ont été envoyés en double exemplaire si le laboratoire effectuait toutes les analyses prévues dans l’opération.
Les échantillons 14-E1, 14-E2, 14-E3, et 14-E4 contenaient de l’ARN-VHC avec des niveaux de charge virale obtenus lors de la préparation avec le réactif Roche Cobas Taq Man de 5,93 ; 3,70 ; 2,80 et 2,64 log UI/mL respectivement. L’échantillon 14-E5 était négatif en ARN-VHC. Les échantillons étaient de génotype 1 pour les échantillons 14-E1, 14-E2 et 14-E3 et de génotype 2 pour l’échantillon 14-E4.
L’objectif principal de ce contrôle était la détermination de la charge virale et la conclusion apportée par les biologistes. Néanmoins, la dernière opération ayant été réalisé en 2008, il a semblé opportun de demander également lors de cette opération le génotypage.
Les résultats sont très satisfaisants en ce qui concerne la détection de l’ARN-VHC avec des pourcentages de bonnes réponses tous réactifs confondus allant de 97 à 100%.
Les résultats de la quantification ont été analysés par réactif. Ceux-ci sont également satisfaisants. Pour chacun des réactifs utilisés, les statistiques de cohérence révèlent un faible nombre de valeurs aberrantes que ce soit pour les niveaux faibles d’ARN-VHC (aux alentours de 2,5 log UI/mL, échantillons 14-E3 et 14-E4) ou pour le niveau plus élevé (5,7 log UI/mL, échantillon 14-E1). Les moyennes des résultats obtenus avec les deux réactifs de PCR en temps réel (Abbott real Time HCV et Roche Cobas Taq Man quantitative v.2.0) sont statistiquement différentes mais les écarts entre elles, quel que soit le niveau d’ARN-VHC étudié, sont faibles, (de l’ordre de 0,3 log UI/mL) et sans impact clinique significatif. Le réactif Roche donnant en moyenne des résultats plus élevés que le réactif Abbott quel que soit le niveau considéré.
La détermination du génotype était proposée pour la seconde fois dans une opération du Contrôle national de qualité. Pour un quart des laboratoires, la détermination du génotype sur les échantillons 14-E3 et 14-E4 a été infructueuse du fait de la faible charge virale de ces échantillons. Les méthodes concernées par cette absence de résultat ne relevaient pas d’une technique en particulier. Les laboratoires ayant fourni un résultat ont obtenu 100% de réponses exactes pour tous les génotypes sur les échantillons 14-E1, 14-E2 et 14-E3, et 91 % de bonnes réponses sur l’échantillon 14-E4 (3 génotypes erronés).

Echantillons 14-E1, 14-E2, 14-E3, 14-E4, 14-E5 : ARN du virus de l'hépatite C