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Résumé de l’opération

Cette opération de contrôle comportait deux souches lyophilisées à identifier : Aerococcus urinae et Actinotignum (Actinobaculum) schaalii, deux uropathogènes émergents dont la prévalence dans les infections urinaires est sous-estimée. En effet, les conditions de culture habituellement utilisées lors de l’examen bactériologique des urines ne leur sont pas favorables. Par conséquent, il est nécessaire de les évoquer en cas d’infection urinaire chez un patient âgé avec des facteurs prédisposants, en présence de nombreux cocci Gram + en amas ou de bacilles Gram + à l’examen direct, d’une leucocyturie significative et d’une uroculture « stérile » et/ou une absence de réponse clinique à un traitement empirique à la ciprofloxacine ou au cotrimoxazole. Dans ce cas, il est nécessaire de réaliser une culture sur gélose au sang de mouton en anaérobiose ou sous 5% CO2 pendant au moins 48H, d’effectuer l’identification par Maldi-tof (seule technique autre que la biologie moléculaire à identifier A. schaalii) et de traiter par des β-lactamines.
On note une nette progression des performances de l’identification de l’espèce A. urinae avec 85% de diagnostics corrects, soit + 67% par rapport à l’envoi précédent en 2002. En revanche, A. schaalii, proposé pour la première fois dans le cadre du CNQ a été identifié par seulement 30% des participants, car cette espèce ne fait pas encore partie des bases de données des galeries et des automates d’identification majoritairement utilisés dans les LBM.

En ce qui concerne l’antibiogramme, deux souches lyophilisées d’Escherichia coli de sensibilité diminuée (I ou R) à au moins un carbapénème ont été proposées. Chez les entérobactéries, la résistance aux carbapénèmes est majoritairement due à une association de mécanismes de résistance (céphalosporinase et/ou BLSE associée à une perte de perméabilité membranaire) et plus rarement à l’acquisition de gènes codant pour des carbapénémases. L’émergence et la dissémination des entérobactéries productrices de carbapénémases (EPC) est un problème de santé publique. C’est pourquoi, toute diminution de la sensibilité aux carbapénèmes sur l’antibiogramme doit faire suspecter une carbapénémase dont la présence éventuelle, si elle est confirmée par des tests complémentaires, doit être signalée à l’ARS.
La souche du lot 1, résistante à l’ertapénème (CMI = 3-4 mg/L) et sensible à l’imipénème (CMI = 0,75 mg/L), produisait une β-lactamase à spectre étendu (BLSE) du groupe CTX-M-15 associée à une imperméabilité. Près de neuf LBM sur dix ont détecté la BLSE. En revanche, seul un LBM sur cinq a rendu le diagnostic attendu « BLSE + imperméabilité ». Enfin, 44% ont indiqué « carbapénémase » (soit seule soit associée à un autre mécanisme de résistance), ce qui montre la nécessité de confirmer qu’il s’agit bien d’une carbapénémase et de l’identifier afin d’éviter tout surdiagnostic.
La souche du lot 2, résistante ou intermédiaire à une dilution près à l’ertapénème (CMI = 2-3 mg/L) et sensible ou intermédiaire à une dilution près à l’imipénème (CMI = 1,5-2 mg/L) produisait une carbapénémase OXA-48, la plus fréquente en France. Près d’un LBM sur huit a signalé la présence d’une carbapénémase, ce qui est un bon score étant donné le phénotype de résistance des souches productrices d’OXA-48 qui peut être inhabituel (CMI des carbapénèmes basses ou à la limite des concentrations critiques).

Identification bactérienne : Aerococcus urinae et Actinobaculum schaalii / Antibiogramme : E. coli CTX-M-15 + imperméabilité et E. coli OXA-48