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Résumé de l’opération

Cette opération comportait deux souches lyophilisées d’E.coli, toutes deux productrices d’une pénicillinase acquise de type TEM-1. Les trois quarts des participants ayant réalisé un antibiogramme ont détecté la présence d’une pénicillinase et environ 15% ont évoqué une pénicillinase résistante aux inhibiteurs.
Il s’agissait de deux EPEC (E. coli entéropathogènes) dont les sérotypes précis sont les suivants :
E. coli O26 :H- (lot 1) et E. coli O55 :H2 (lot 2).
Interrogés sur l’appartenance de la souche testée à un des quatre pathovars entériques suivants de E. coli : EHEC/STEC (E. coli producteur de Shigatoxines), EPEC (E. coli entéropathogène), ETEC (E. coli entérotoxinogène) ou EAEC (E. coli entéroaggrégant), les deux tiers des laboratoires (397/600) ayant inclus et/ou exclu au moins un pathovar ont identifié un EPEC. En ce qui concerne le sérogroupe O des deux souches, seuls 186 laboratoires l’ont déterminé précisément. On observe 97% de bonnes réponses E. coli O26 (lot 1) et 81% de bonnes réponses E. coli O55 (lot 2). Pour ce dernier lot, les erreurs (en majorité E. coli O157) viennent du fait que la souche était sorbitol négatif.
Dans le prolongement du diagnostic du pathovar entérique et du sérogroupage O des deux souches proposées, cette opération de contrôle a été l’occasion de réaliser en collaboration avec le CNR, une enquête plus générale sur les techniques utilisées dans les LBM pour la recherche des pathovars entériques de E. coli. Le questionnaire comportait quatre questions principales concernant la recherche des gènes de virulence par PCR, la recherche de Shiga-toxines par des tests immunologiques rapides, l’utilisation de milieux de culture chromogéniques ou de type Mac Conkey sorbitol pour la recherche des EHEC et enfin le sérogroupage (latex ou antisérums agglutinants).
Fin 2013, on note que 25 laboratoires (24 en métropole et 1 dans les DOM-TOM) réalisent la recherche des gènes de virulence (au minimum stx1 et stx2) par PCR.

Cette opération comportait également deux échantillons lyophilisés (S1 et S2) destinés au sérodiagnostic de la syphilis par deux tests relevant chacun d’un des deux groupes réglementaires de techniques (groupe 1 : tests cardiolipidiques, groupe 2 : tests tréponémiques). Chacun des 1252 laboratoires ayant déclaré réaliser cette sérologie a reçu un des deux échantillons.
Les résultats obtenus avec les tests cardiolipidiques sont satisfaisants pour l’échantillon négatif S2 pour lequel on note 95% de dépistages corrects. En revanche, le pourcentage de faux négatifs (8,4%) obtenus avec l’échantillon positif S1 (VDRL = 2) est trop élevé mais n’est pas dû à un réactif particulier.
Les résultats des tests tréponémiques sont excellents (97,8% de réponses correctes) avec l’échantillon S1 fortement positif (TPHA = 320-640). En revanche, l’échantillon S2 de titre faible, égal au seuil (TPHA = 80) a été dépisté « négatif » à tort par 45% des laboratoires. Cet échantillon prouve l’intérêt qu’il y aurait à passer à des tests plus sensibles que le TPHA en dépistage.
En ce qui concerne le titrage des échantillons dépistés positifs en VDRL ou TPHA, on note un pourcentage élevé de titres conformes. Quel que soit le réactif considéré, le titre modal obtenu est identique ou ne s‘écarte que d’une dilution du titre modal tous réactifs confondus.

Escherichia coli : Antibiogramme et pathovars entériques / Enquête sur les techniques utilisées dans les LBM pour la recherche des pathovars entériques de E.coli / Sérodiagnostic de la syphilis